מכון שילובים, הממוקם בעיר יבנה, הוקם במקור בקיבוץ גבעת ברנר בשנת 1996 ופעל בקיבוץ כ-25 שנים, עד דצמבר 2020. המכון פועל כמרכז הכשרה להסמכת מטפלים זוגיים ומשפחתיים ומדריכים בטיפול זוגי ומשפחתי, וכמרכז השתלמויות, הדרכה וטיפול בפרט, בזוג ובמשפחה.
שמו של המכון מעיד גם על שיטת הלימוד: אוריינטציה מערכתית וגישה מטא-מודרניסטית המשלבת בין גישות קלאסיות וחדשניות, עם דגש על הגישה הפסיכודינמית. התפישה הפלורליסטית הזו מאפשרת לסטודנט לפתח חשיבה מערכתית אינטגרטיבית, כשהדגש הפסיכודינמי מאפשר מרחב להגדלת המובחנות התוך והבין-אישית של המטופלים.
הלמידה לאורך השנתיים הראשונות מתקיימת בקבוצה קבועה ומוגדרת, המאפשרת תהליך שבו מיושמות מיומנויות הטיפול במסגרת הקבוצה — ביטחון קבוצתי שתורם לעיבוי הלמידה והפנמתה. המכון אף דוגל בשילוב בני זוגם, ילדיהם או הוריהם של הסטודנטים סביב נושאים מסוימים, ומתמחה בשילוב משחק וקלפים טיפוליים במרחבי הטיפול השונים.
תוכנית הכשרת המטפלים אורכת בין שנתיים לשלוש שנים: בשנה א׳ וב׳ מושלמות כל הדרישות התיאורטיות וכל שעות ההדרכה הקבוצתית, בהתאם לקריטריונים להסמכה של האגודה לטיפול זוגי ומשפחתי (למעט סטודנטים המוגדרים במסלול א׳, שבקריטריונים של האגודה). בשנה ג׳ מתקיים פרקטיקום במסגרת קבוצתית קטנה, המאפשר השלמת מחצית משעות ההדרכה החיה, 15 שעות הדרכה פרטנית ו-15 שעות טיפול.
